磺酸基-Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯,Sulfo-Cyanine3 NHS ester

产品简介

      菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的，其琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度, 可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。

菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物;另外,Cy5, Cy5.5和Cy7的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料。特别适合于活体小动物体内成像代替放射性元素。

菁染料琥珀酰亚胺酯（SulfoCy NHS）的标记染料的特点

菁染料和生物分子的比例F/P=4～12之间荧光强度最高，F/P值过高荧光探针会自我淬灭并影响生物分子的生物活性，标记生物分子最好是用单琥珀酰亚胺酯，但是用双修饰的CyDye NHS并没有发现交联。CyDye NHS标记抗体在pH (8.5～9.4)时10分钟F/P可达5～6，而在pH 7.0几乎不反应。我们用不同比例的Cy3标记anti-glutathione-S-transferase (GST)多克隆抗体发现用1:1, 5:1, 10:1 和20:1标记时得到的F/P值分别是0.28:1, 1.16:1, 2.3:1 和4.6:1。

基本特性

CAS No:146368-16-3

中文名称:磺基-Cy3-N-羟基琥珀酰胺酯 

英文名称:Cyanine 3, SE 

别名:2-(3-(1-(6-((2,5-二氧杂吡咯烷-1-基)氧基)-6-氧己基)-3,3-二甲基-5-磺基吲哚-2-亚烷基)丙-1-烯-1-基)-1-乙基-3,3-二甲基-3H-吲哚-1-鎓-5-磺酸  2-(3-(1-(6-((2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindolin-2-ylidene)prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate 

分子式:C₃₅H₄₁N₃O₁₀S₂

分子量:727.84 

产品应用及操作步骤

一 .水溶性SulfoCy3 NHS标记anti-GST多克隆抗体

[注意]市场上买到的抗体如果含有其它蛋白（例如serum albumin或gelatin等）或带氨基的缓冲液会影响标记，在标记前需纯化。

1.在1 L 0.15 M NaCl 溶液中透析anti-GST抗体(浓度为0.5 mL at 3 mg/mL)，常温透析4小时。

2. 在4°C用新鲜的1 L 0.15 M NaCl 溶液再透析过夜。

3. 第二天用1 L 0.1 M NaHCO3(pH 8.3)透析4小时。

4. 用0.22 μm注射器过滤头过滤抗体溶液。

5. 用0.1 M NaHCO3稀释少量的抗体，在280nm处测其紫外吸收值计算标记抗体的总量（IgG antibody摩尔吸光系数170 000 M-1cm-1at 280 nm). 

6. 用无水DMSO配置Cy3 NHS (MW 765.95)溶液浓度为10 mg/mL；计算所需体积以得到想要的CyDye NHS 和抗体的比值(例如20:1)，然后慢慢将其加入到抗体溶液中，同时在暗处常温缓慢搅拌45分钟。(无水DMSO)

7. 用1 L 0.15 M NaCl 溶液常温避光透析4小时除去未标记上的Cy3。

8. 在4°C用新鲜的1 L 0.15 M NaCl 溶液再避光透析过夜。

9. 用1 L of 0.01 M PBS/ 0.01% 叠氮化钠溶液常温避光透析4小时, 在4°C常温避光再次透析过夜。

10. 用0.22 μm注射器过滤头过滤抗体溶液。

11. 用0.01 M PBS/0.01 % 叠氮化钠整数倍稀释标记抗体溶液，测量280nm（蛋白）和552nm（Cy）处的紫外可见吸光度。

12. 产品冷冻干燥成粉末或在0.01 M PBS/ 0.01% 叠氮化钠溶液中，-20℃避光储存。

F/P计算

SulfoCy3在552nm摩尔吸光系数为150 000 M-1cm-1；此蛋白在280nm的摩尔吸光系数为170 000 M-1cm-1；不同蛋白的摩尔吸光系数不一样；.Cy3 染料本身在280 nm 的吸收是552nm处的8%。按以下公式计算F/P值。

[Cy3] = A552/150000

[antibody] = {A280- (0.08×A552)}/170000 

F/P final= [Cy3]/[antibody]= {1.13×A552}/ {A280- (0.08×A552)}